浙江省醫藥工業有限公司的前身是浙江省醫藥工業公司，成立于1976年，是原省醫藥管理局直屬管理全省藥品生產的行政性公司。1986年起逐步轉軌變型為經營性公司，經營規模不斷擴大，連續20年被評為浙江省信用優等企業。
1998年省政府決定將原省醫藥管理局直屬的經營公司合并成為浙江英特藥業有限責任公司。1999年改制，由浙江海正藥業股份有限公司（股票代碼600267）和英特藥業共同出資、在原浙江省醫藥工業公司的基礎上組建成立了浙江省醫藥工業有限公司。2005年海正藥業收購浙江英特藥業持有公司39%的股權，現浙江海正藥業股份有限公司持有公司85%的股權，為公司的控股股東。公司具有獨立的法人資格，注冊資本10600萬元。
公司業務范圍包括中成藥、化學藥制劑、化學原料藥、抗生素、生化藥品、生物制品、麻醉藥品、精神藥品、麻黃素、醫藥中間體、制藥機械及配件、醫藥包裝材料、醫療器械、獸藥、保健食品、危化品等，同時也是國家藥品監督管理局指定的浙江省麻黃素唯一經營單位及咖啡因、二級麻醉藥品經營單位，其中重點經營海正產品；銷售網絡遍及全國26個省、市、自治區，公司擁有一批高素質的專業藥品推廣隊伍，并與全國各大醫療單位、生產企業及經營企業保持良好和密切的合作關系。保證經營藥品質量、提高服務態度、滿足客戶需求是公司經營宗旨。
公司擁有良好的倉儲設施和經營環境員工素質較高，技術人員占員工總數的70%，其中中級以上職稱的占15%；有健全各級質量管理機構，完善質量保證體系，于2001年5月首批通過國家藥監局GSP現場認證，獲認證證書（證書號為A-2J01-002）。目前公司已建立內部信息化管理系統，實現了經營、財務、倉儲等業務（進、銷、存、運）的計算機一體化管理。
改制后的公司，經營規模、經營范圍不斷擴大，全國醫藥商業企業銷售百強榜排名由2006年的33位上升到2008年的31位。2009年銷售突破30億元，利稅達1.5億，由原來的國有中型企業一舉成為國有控股的大型醫藥流通企業。
公司純銷業務覆蓋全省縣以上醫院近400家，公司為輝瑞、楊森、強生、中美史克、拜耳等知名品牌企業的浙江省一級代理商。
公司的發展戰略是“以海正產品為拳頭，以終端網絡為基礎，以學術推廣為手段，以經濟效益為目標，成為型的醫藥商業企業”。